自闭症多基因负担升高与出生时DNA甲基化差异有关

日期: 2024-10-28

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敏泰生物 译



  研究背景:自闭症谱系障碍(ASD)是一种严重的神经发育障碍,其特征是社会沟通缺陷和限制、重复的行为、兴趣或活动。ASD的病因学涉及遗传和环境风险因素,表观遗传过程被假设为遗传和非遗传变异影响基因调控和发病的一种机制。这项研究的目的是确定出生时可检测到的ASD DNA甲基化生物标志物。
  研究方法:我们对1263名婴儿(其中约50%后来发展为自闭症)的新生儿甲基组变异进行了量化,使用的DNA是从出生后不久采集的存档血斑中分离出来的。我们使用来自相同个体的匹配基因型数据来检查ASD相关遗传风险变异的分子后果,确定与ASD多基因负担升高相关的甲基组变异。此外,我们进行了DNA甲基化定量性状位点(mQTL)定位,以优先考虑ASD GWAS发现的靶基因。
  研究结果:我们确定了胎龄和产前烟草暴露的强大表观遗传特征,证实了新生儿血斑产生的DNA甲基化数据的实用性。虽然我们没有发现新生儿DNA甲基化与后期ASD相关的特异性位点,但自闭症多基因负担的增加与特定位点的甲基化变异之间存在显著关联。ASD多基因风险评分每升高一个单位,与8号染色体上ASD的强大GWAS信号附近的两个CpG位点的DNA甲基化平均增加-0.14%相关。
  结论:这项研究是对ASD中DNA甲基化进行的最大规模的分析,也是第一次整合出生时的遗传和表观遗传变异。我们展示了使用多基因风险评分来识别与疾病相关的分子变异的实用性,以及使用mQTL来完善与ASD风险变异相关的功能和调控变异的实用性。